在三峡工程开工之前，曾经历了长达近40年的科研与论证，其中关于水库的生态与环境就是科研与争论的重要内容之一。
为了确保三峡库区的生态安全，国务院在2001年批准实施了《三峡库区及其上游水污染防治规划》，从2001年起到2010年,国家共安排392.2亿元国债资金用于三峡库区及其上游的污染治理，目前，三峡库区城镇已建成58座污水处理厂和41个垃圾处理场，同时关停破产了1500多家会造成污染的工矿企业。
2006年三峡大坝全线建成并实现了初期156米水位蓄水的目标，那么大坝建成这一年来三峡库区的生态环境如何？ 当年关于三峡库区可能出现的生态影响，如今在现实中又有了怎样的答案呢？
李小萌：今天我们也是面对事实，用事实说话，我们整理了一下三大方面跟三峡工程有关的问题，咱们来逐个解决一下。第一个，水库蓄水之后，水流缓慢，导致水富营养化问题出现。这个问题您来解答。
汪啸风：您提出第一个问题，它涉及到水体的降解能力，三峡库区的变化，从一条长江干流变成了一个河道性的水库，这个水库形成以后，它有增加降解能力的可能，水体加大以后，降解能力自然会增大，这也是有科学依据的。同时它也会造成流速减缓和上下水体的交换减弱，这样也可能对像富营养化这些情况产生加速的一些因素，但现在解决问题有一个关键措施是很有效的，就是成库以后，在库区截污方面采取了重大的措施，这是原来所没有的，就是把污染源截流在水库之外，而在地面进行处理，这样对于富营养化的问题，除了工程措施以外，还有生物等等措施，它是可以解决好的。
李小萌：但同时我们也看到一些报道说，长江的一些支流出现水华的现象比较严重，这个问题我们请国务院三峡办水库司副处长王殿常博士解释一下。
王殿常：关于三峡库区支流富营养化的问题，是因为整个三峡库区的支流污染负荷背景值本来就很高，三峡蓄水以后，因为受到回水的顶托，在合适的气候条件下，局部的水域藻类会大量繁殖，就是说在三峡部分支流的局部水域短时间内会出现富营养化现象，主要就是表现为水华，这个问题在三峡的论证和可行性研究阶段都已经预测到了，现在看来这个问题是并不严重，只是在部分支流的局部水域短期内，主要是在春季出现。
李小萌：你说短期出现，那就是说这个短期什么时候能过去，过去之后就不再出现类似的现象了吗？
王殿常：这个所谓的短期是指阶段性的，和气候的条件、降雨都有很大的关系，比如说在春季温度突然升高的时候，藻类会大量繁殖，在局部水域可能会出现水华的现象，但是如果说来了一场雨，下雨以后，这个问题就会得到缓解。
李小萌：王博士讲得很严谨，但是专业性也很强，水博先生您给我们通俗化一点解释一下。三峡工程对于整个长江流域的水污染问题，究竟是正向的影响还是负面的影响呢？
张博庭：通俗化说，就是水库建成不一定就要把水质变坏，也有变好的可能，什么情况下会变坏呢？就是说污染排放非常严重，污染排放非常严重，又得不到治理，这时候它在水库里不断地需要耗氧量非常大，没有这么大氧，最后出现水富营养化。
李小萌：您意思就是说关键问题还是解决污染排放问题。
张博庭：污染排放只要小到一定程度，因为水库水质的净化本身还有生物进化非常有作用，比如说里面有些草类、鱼类、自然生态系统，为什么人类历史几千年了，从来没有哪个自然湖泊发生过富营养化，什么蓝藻，这种情况根本没有，就是因为你不排污，不是人类的这种化学污染这种污染进去，不会有这种情况，本身如果仅仅建一个水库，其实很可能是水质变好，一般的情况应该是这样。
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